高壓滅菌器是用于消毒的各種類型的媒體，通過在壓力下的干飽和蒸汽的手段加熱室。為了獲得干燥的飽和蒸汽，必須從高壓滅菌器內的材料和高壓滅菌器腔室本身中除去空氣。 這可以通過多種方式來實現。
為了從質量大但表面積小的物品（例如瓶裝介質）中去除空氣，需要的去除空氣zui少，并且自動空氣吹掃就足夠了，例如臺式高壓滅菌器。在這種情況下，當蒸汽從一體式源（向上排量）或從外部供應源（向下排量）進入時，允許空氣排出腔室。僅當從腔室中除去所有空氣后，通風孔才會關閉。進一步推廣這種方法是“自由蒸煮”，在這種情況下，允許通風口保持打開狀態一段設定的時間。然后，湍流蒸汽通過排氣孔，迫使殘留的空氣排出高壓滅菌器。對于包括許多氣袋（例如，包裹的儀器或織物）的更困難的負載，需要更主動的排氣方法。
去除空氣zui活躍的方法是通過真空系統。使用真空系統時，在引入任何蒸汽之前以及在進行自由蒸汽或真空脈沖之前，應先將腔室排空。從腔室和介質中除去空氣后，容器內的溫度將隨壓力升高，直至達到預設溫度。蒸汽加壓到至少1.1 Bar G時，滅菌溫度達到249.8F。由于壓力大于0.5 Bar G，高壓滅菌器被歸類為壓力容器，必須設計并通過ASME標準的認證，例如實驗室方形高壓滅菌器。
有多種方法可以在高壓滅菌器室內達到溫度和蒸汽：
蒸汽發生器或直接蒸汽的主要優點在于，周期時間可以大大縮短，而即時蒸汽不需要等待室內的熱水。在室內裝有基本加熱器的情況下，必須手動補充水，一旦水沸騰就提供蒸汽。
當達到所需的溫度和循環時間時，蒸汽供應將停止，溫度和壓力將開始逐漸下降。如果系統中包含真空系統，則可以更快速地排空蒸汽，以在循環結束時產生干燥機zui終產品。
滅菌后，可以移走物品（培養基，玻璃器皿，包裹的儀器等）并在實驗室中安全可靠地使用；或丟棄廢物時，可以離開實驗室。
